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Katsuyuki EGUCHI, Assoc. Prof.

Systematic Zoology Group

■ キーワード  Keywords

Taxonomy, Systematics, Museomics, Terrestrial Invertebrates, Soil Fauna, Field Research, Southeast Asia, Cave, Introduced Species, ABS (Nagoya Protocol), Local Contribution

Taxonomy, Systematics and Phylogeography of Terrestrial Invertebrates

The Indochina region is a region of high species diversity, endemism, and persistence in various flora and fauna groups. In addition, in the mountainous areas of northern Indochina, the faunas of the Palearctic and the Oriental realms are mixed.
Our research group is working on various taxa of terrestrial invertebrates in Southeast Asia, especially in the Indo-China region, aiming to elucidate local faunas, to update the classification (taxonomic system), and to understand the spatial distribution of taxa and their formation process. We use not only morphological observations and analyses but also phylogenetic analyses for sequence datasets obtained by Sanger sequencing as well as next-generation sequencing.
I have collaborated with researchers affiliated with institutions in Vietnam, Laos, Thailand, Malaysia, Indonesia, Brunei, Taiwan, China, and other countries, and have conducted joint research and field surveys. Our research has covered a wide range of invertebrate taxa, including ants, wasps, hemipterans, termites, centipedes, millipedes, symphylans, spiders, pill isopods, and blood-sucking leeches, and the results have been published in numerous papers.

■ プレスリリース Press release






■ EurekAlert!

■ その他の取材記事 Other news article



Our group has accepted many international students from Southeast Asian countries and regions who will become the future leaders in biodiversity research.

■ 留学生受入実績
  • 2022年10月〜2024年9月(予定):東京都奨学金、修士、ラオス

  • 2022年10月〜2024年9月(予定):東京都奨学金、修士、ネパール

  • 2022年10月〜2024年9月(予定):東京都奨学金、修士、スリランカ

  • 2022年10月〜2025年9月(予定):東京都奨学金、博士、ラオス

  • 2021年10月〜2023年9月(予定):東京都奨学金、修士、インドネシア

  • 2019年10月〜2021年9月:東京都奨学金、修士、ベトナム

  • 2018年10月〜2023年9月(予定):東京都奨学金、修士+博士、ベトナム

  • 2018年10月〜2021年9月:東京都奨学金、博士、台湾

  • 2017年10月〜2021年9月:国費留学制度、研究生+博士、ベトナム

  • 2016年10月〜2019年9月:東京都奨学金、博士、ベトナム

  • 2016年4月〜2018年3月:私費、修士、台湾

  • 2014年10月〜2017年9月:東京都奨学金、博士、インドネシア

  • 2014年10月〜2017年9月:東京都奨学金、博士、ベトナム

■ JSPS外国人特別研究員受入実績
  • 2022年11月〜2024年11月:台湾

  • 2018年11月〜2020年11月:Francesco Ballarin、イタリア

■ Hosting foreign students funded by TM (Tokyo) or MEXT (JAPAN)
  • 2022/10 – 2024/09: MC, Laos, TM

  • 2022/10 – 2024/09: MC, Nepal, TM

  • 2022/10 – 2024/09: MC, Sri Lanka, TM

  • 2022/10 – 2025/09: DC, Laos, TM

  • 2021/10 – 2023/09: MC, Indonesia, TM

  • 2019/10 – 2021/09: MC, Vietnam, TM

  • 2018/10 – 2023/09: MC+DC, Vietnam, TM

  • 2018/10 – 2021/09: DC, Taiwan, TM

  • 2017/10 – 2021/09: RS+DC, Vietnam, MEXT

  • 2016/10 – 2019/09: DC, Vietnam, TM

  • 2014/10 – 2017/09: DC, Indonesia, TM

  • 2014/10 – 2017/09: DC, Vietnam, TM

■ Hosting JSPS Postdoctoral Fellowships for Research in Japan
  • 2022/11 – 2024/11: Taiwan

  • 2018/11 – 2020/11: Italy
Other Activities
■ 海外との学術交流  Academic International collaboration

As a part of the National BioResource Project (Phase 5), supported by the Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology of Japan (MEXT), our group has launched "Support for the Access and Use of Genetic Resources in Biodiversity Science, based on the Study of ABS-related Cases in Asia," and has provided advice and support to domestic research institutions on how to comply with new rules and customs related to CBD-ABS (the Nagoya Protocol), and collect information on laws and regulations related to ABS outside Japan.

In collaboration with overseas collaborators, our group has organized research meetings and workshops on terrestrial invertebrates and other wild organisms in Southeast Asia. In addition, taking advantage of the financial support provided by the Graduate School of Science of TMU and other programs, graduate students stay for one to two months at joint research institutions in Vietnam and other countries, and conduct field research and workshops with graduate students and young researchers at the sending institutions. Young researchers from overseas frequently visit our laboratory to conduct field research and laboratory experiments with Japanese members.

■ 自治体などとの連携事業  Collaborative Projects with local governments, etc.

In cooperation with the Tokyo Metropolitan Government and local governments in Tokyo, we are working to elucidate the distribution status, habitat suitability, and life history of introduced invertebrates in the Ogasawara Islands and Izu Islands.


I provide research themes and technical guidance, and give lectures to high school teachers who are members of the Tokyo Biology Education Research Association, as well as to biology teachers who lead "Integrative Study Class" in the formal curriculum and "Biology Clubs".

■ 学外委員など  Off-campus Professional Activities
  • 長崎大学熱帯医学研究所・客員准教授

  • 東京都立大学牧野標本館ABS支援チーム・責任者

  • ナショナルバイオリソースプロジェクト第5期分担事業「アジアにおけるABS関連実務事例の研究に基づく、多様性生物学分野での遺伝子資源取得・利用に対する支援活動」・分担課題管理者

  • 八丈町「アシジロヒラフシアリ対策」・外部アドバイザー

  • 日本分類学会連合・広報出版委員会・ニュースレター担当

  • 日本分類学会連合・ABS問題対策ワーキンググループ・委員

  • 日本分類学会連合・国立自然史博物館新設ワーキンググループ・委員

  • 日本昆虫学会・編集理事(「昆蟲(ニューシリーズ)」・編集委員長)

  • 日本昆虫学会・「昆蟲(ニューシリーズ)」編集委員会・ABSアドバイザリー

  • 日本昆虫学会・将来問題検討委員会・委員

  • ベトナム科学技術アカデミー発行「Academia Journal of Biology」誌・編集委員会委員

  • 日本土壌動物学会・編集委員会・ABSアドバイザリー

  • 日本原生生物学会・編集委員会・ABSアドバイザリー

  • 「Myrmecological News」誌・編集アドバイザー
Francesco Ballarin特任助教が行っている研究
Research being conducted by Assistant Prof. Francesco Ballarin

My research area of interest is principally focused on the study of the evolutionary and biological processes that shaped the modern distribution of subterranean and soil fauna in Eurasia in relation with climatic and geological events occurred during the Cenozoic Era. In my studies I use spiders (Arachnida, Araneae) as the main model animal of which I study in detail taxonomy, phylogeny and biogeography. I am also interested on the study of the ecology and conservation of the invertebrate fauna in caves and the effect of the Global Warming on their communities.
Since 2010 I am member of the International Society of Arachnology and the International Society of Speleology. In the past years I had the occasion to visit numerous caves and survey the subterranean habitats in several different countries in Eurasia (China, France, Greece, Italy, Japan, Philippines, Spain, Taiwan, Thailand, etc.). Results of these studies have been summarized in several international journals and reported in local and international congresses. One of my works in particular shed new light on evolution of Asian cave spiders highlighting how epigean were forced to adapt to subterranean environment by the rising adverse conditions occurred during the Mid-Miocene Climatic Change (~14 Mya). My current working web involves collaborations with several researchers from international institutes in Europe and Asia. In addition to taxonomy, evolution and diversity of subterranean organisms I am also working in conservation of subterranean environments and the effects of invasive species on endemic cave fauna.
具体的な研究 (1) — ナギナタアリOpamyrma hungvuong Yamane, Bui & Eguchi, 2008の比較形態学的研究
Unveiling the morphology of the Oriental rare monotypic ant genus Opamyrma Yamane, Bui & Eguchi, 2008 (Hymenoptera: Formicidae: Leptanillinae) and its evolutionary implications, with first descriptions of the male, larva, tentorium, and sting apparatus
 極めて発見例の少ないナギナタアリOpamyrma hungvuong Yamane, Bui & Eguchi, 2008のコロニーをベトナム北部と中国南部(広西)から再発見し、オスや幼虫も含めた包括的な形態学的記載を初めて行った。本種は最近の分子系統学的研究でムカシアリ亜科の最も分岐の古い系統である可能性が示唆されていたが、今回、形態学的にもそのことを支持する証拠が得られた。特に重要な知見として、本属を含むムカシアリ亜科のアリは、他のアリとは大きく異なる毒液排出機構を共通して持つことがわかった。本亜科に属するムカシアリ属やジュズフシアリ属では、アリ類で一般的に見られる毒液を送り出すための弁(lancet valve)が失われており、代わりに毒嚢の収縮による力を用いて毒液を排出していると考えられていた。今回、ナギナタアリの毒針形態を調べたところ、本種もこの特徴を共有していることがわかった。このことは、弁の欠失と毒嚢の収縮による毒液排出機構が本亜科の共有派生形質であることを示唆していた。

The monotypic genus Opamyrma Yamane, Bui & Eguchi, 2008 (Hymenoptera, Formicidae, Leptanillinae) is an extremely rare relictual lineage of apparently subterranean ants, so far known only from a few specimens of the worker and queen from Ha Tinh in Vietnam and Hainan in China. The phylogenetic position of the genus had been uncertain until recent molecular phylogenetic studies strongly supported the genus to be the most basal lineage in the cryptic subterranean subfamily Leptanillinae. In the present study, we examine the morphology of the worker, queen, male, and larva of the only species in the genus, Opamyrma hungvuong Yamane, Bui & Eguchi, 2008, based on colonies newly collected from Guangxi in China and Son La in Vietnam, and provide descriptions and illustrations of the male, larva, and some body parts of the worker and queen (including mouthparts, tentorium, and sting apparatus) for the first time. The novel morphological data, particularly from the male, larva, and sting apparatus, support the current phylogenetic position of the genus as the most basal leptanilline lineage. Moreover, we suggest that the loss of lancet valves in the fully functional sting apparatus with accompanying shift of the venom ejecting mechanism may be a non-homoplastic synapomorphy for the Leptanillinae within the Formicidae.

■ 論文  Article
Yamada A, Nguyen DD, Eguchi K. 2020. Unveiling the morphology of the Oriental rare monotypic ant genus Opamyrma Yamane, Bui & Eguchi, 2008 (Hymenoptera: Formicidae: Leptanillinae) and its evolutionary implications, with first descriptions of the male, larva, tentorium, and sting apparatus. Myrmecological News, 30, 27-52.
具体的な研究 (2) — 日本最大の新種のオオムカデの発見 — 形態観察と分子系統解析を組み合わせた種分類
A new amphibious species of the genus Scolopendra Linnaeus, 1758 (Scolopendromorpha, Scolopendridae) from the Ryukyu Archipelago and Taiwan
オオムカデ属Scolopendra Linneus, 1758は、分類学の父リンネによって創設された分類群である。世界からは100種が記載されているが、多くの種では散発的な分布記録があるだけで、分布範囲の詳細は不明であり、再検討を要する状況にある。大型であるため、種間差を示す特徴を多く持ちそうに思うかもしれないが、実際には、種の間での形態的な差異が少ない一方で、色彩などには種内でしばしば大きな個体差が見られることが知られており、種レベルの分類が混沌としている。
日本からはこれまで、「トビズムカデ (Scolopendra mutilans)」、「アオズムカデ (Scolopendra japonica)」、「タイワンオオムカデ (Scolopendra morsitans)」、「オオムカデ (Scolopendra subspinipes)」が記録されていた。しかし、沖縄県本島北部の、やんばる地域にはかなり前から大型のオオムカデがいることが噂となっており、2010年ごろからは飼育愛好家の間では広く知られる存在になってきた。しかし、生息場所であるやんばる地域の自然環境が開発によって破壊されていく中、個体群の減少や絶滅が危惧されたため、種としての実態を明らかにすることに着手した。様々な行政的措置を行う上で、種名が確定していることが極めて重要だからである。
本種が美しい青緑色(ひすい[翡翠]色)の体色をしていることと、川に飛びこむ姿から、同様に美しい体色 の鳥であるカワセミとおなじく、ギリシャ神話の女神アルキオーネの名前にちなみ、学名を Scolopendra alcyona とした。一方、和名は沖縄の故事にちなんでリュウジンオオムカデ(琉神大百足)とした。体長約20cm、体幅2cm以上になる巨大種である。沖縄本島北部(やんばる地方)の深い森、久米島、西表・石垣島、渡嘉敷島、そ して、台湾に生息することが判明している。身の危険を感じると水中に逃げ込み、じっと身を隠す習性をもつ。さらに、同地域に生息し、体調10cmにもなる日本最大の川エビ「コンジンテナガエビ」を捕食しているところが目撃されている。過去に半水棲ムカデは、2016 年にラオス、ベトナム、タイから 1 種、2018 年にフィリピンからの 1 種が報告されて おり、世界で 3 例目となる。
日本からオオムカデ属の新種が記載されるの は、アオズムカデ(Scolopendra japonica)とトビズムカデ (Scolopendra mutilans)がドイツ人の手によ って 1878 年に新種記載されて以降、実に 143 年ぶりとなる。また、日本人の手によって、オオムカデ属の 種が記載されるのは初めてであり、多数の地元の方々の協力なしにはあり得なかった快挙である。21 世紀に入 ってからの、これほどの巨大な陸上無脊椎動物の新種の発見は、沖縄の島々に未知の生物がまだ数多く存在す ることの証左であり、生物多様性や生態系の包括的な保全の必要性を訴えかけるものである。

In Japan and Taiwan, five valid species of the genus Scolopendra Linnaeus, 1758 have been described: S. morsitans Linnaeus, 1758, S. subspinipes Leach, 1816, S. mutilans Koch, 1878, S. japonica Koch, 1878, and S. multidens Newport, 1844. Recently, an undetermined species was found in the Ryukyu Archipelago and Taiwan. Using molecular phylogenetic analyses with mitochondrial COI and 16S rRNA and nuclear 28S rRNA and 18S rRNA genes as well as conventional morphological examination, we successfully discriminated this sixth species as an independent lineage from S. subspinipes, S. mutilans, and other named congeners from East and Southeast Asia. Therefore, the species was described as S. alcyona Tsukamoto & Shimano, sp. nov. Several situational evidences suggest that this species prefers streamside environments and exhibits amphibious behavior.

■ 論文  Article
Tsukamoto S, Hiruta SF, Eguchi K, Liao J-R, Shimano S. 2021. A new amphibious species of the genus Scolopendra Linnaeus, 1758 (Scolopendromorpha, Scolopendridae) from the Ryukyu Archipelago and Taiwan. Zootaxa, 4952, 465-494.

■ プレスリリース  Press release

■ EurekAlert!
具体的な研究 (3) — ベトナムに産するアサヒハエトリグモ属(ハエトリグモ科)の種分類体系の再検討
Revision of the species-level classification of Vietnamese species of the genus Phintella (Family Salticidae)
 ベトナム生態学生物資源研究所の常勤研究員であるPhung Thi Hong Luong氏は、アジア人材育成基金留学生として、江口の研究指導のもとで、アサヒハエトリグモ属の種多様性の解明に取り組んだ。(2017年9月に理学博士号を取得)。

Dr. Phung Thi Hong Luong, a researcher at the Institute of Ecology and Biological Resources in Vietnam, worked under my supervision as a scholarship phD student supported by Asian Human Resources Fund, Tokyo Metropolitan Government and elucidated the species diversity of the jumping spider genus Phintella in Vietnam. She received his Ph.D. in Science in September 2017.
Jumping spiders, or the family Salticidae, are dominant wandering arachnids in tropical and subtropical regions and are a large presence in terrestrial ecosystems as predators of insects and other terrestrial arthropods. The family is taxonomically diverse, with approximately 6,000 valid species (10% of the total number of known spider species), but its taxonomic system is confusing. Because of the very large differences in shape and coloration (sexual dimorphism) between conspecific male and female adults, conspecific male and females have often been classified as different species or even different genera. That is to say that male-based and female-based classifications coexist, and many synonyms are expected to remain. On the other hand, a large number of undescribed species are expected to exist.
In order to solve this problem, she collected a large number of Phintella specimens from Vietnam, and obtained morphological information from each specimen, such as coloration in fresh conditions, DNA sequences of multiple gene regions, and morphology of male and female copulatory organs, which she used in an integrated manner to accurately discriminate the species and to elucidate the correspondence between males and females. As a result, 22 species were discriminated and identified, including 12 new species, increasing the number of known species in Vietnam by 2.5 times.
We Welcome Undergraduate and Graduate Students, and Post-docs!

We are looking for students, graduate students, and post-doctoral fellows who want to engage in interdisciplinary research related to systematics, biogeography, biodiversity informatics, or any combination of these fields! We are conducting international research projects in collaboration with overseas institutions in Vietnam, Indonesia, Thailand, Malaysia, Taiwan, and other countries. If you are a graduate student or above, you can conduct field research in these countries and regions. We also provide consultation for working people (employed people) who wish to enter graduate school. We are always available for consultations by e-mail or in person via Zoom. Visits to our laboratory are also welcome (please send us an email to me in advance).

■ JSPS特別研究員受入実績
  • 2020年4月〜2022年3月:DC2

  • 2014年4月〜2017年3月:PD

■ Hosting JSPS Research Fellowship
  • 2020/04 – 2022/03: DC2

  • 2014/04 – 2017/03: PD

Current Activities (within a year)
Sorry, Japanese only!

■ 2024年2月21日 — 当研究室が八丈町、森林総合研究所と協力して取り組んでいる侵略的外来アリの防除研究が、森林総合研究所のホームページ上で紹介されました。

■ 2024年1月31日 — 洞窟棲1新種を含む、ベトナムに産するオビヤスデ科の分類学的再検討が、ZooKeys誌に掲載されました。

■ 2024年1月19日 — 当研究室で学位を取得したSatriaさん(インドネシア・パダン州立大学)が主著者となり、Leptogenys borneensisのスマトラ島からの初記録、本種オスの形態の初めての記載をまとめた論文が、Zoodiversity誌に掲載されました。

■ 2023年12月28日 — インドネシアに産するのタマヤスデ亜綱のチェックリストが、ベトナム科学技術院の機関誌Academia Journal of Biologyに掲載されました。

■ 2023年12月13日 — 学術協定を締結できたミャンマーのDawei大学、加えてHpa-an大学と、若手研究者への研究支援を軸とする共同研究立ち上げに関して、意見交換をしました。

■ 2023年12月11日 — 数例の発見例しかない単一種Opamyrma hungvuongのみからなるナギナタアリ属のコロニーをベトナム中部山岳地帯でコロニーを採集し、ムカデに対する非常に精緻な捕食行動を観察、報告した論文(主著者・責任著者:山田藍生)が、Asian Myrmecology誌に掲載されました。

■ 2023年12月5日 — ベトナム生態学生物資源研究所と共同で、オンラインセミナー「Genetic and Species Diversity, Endemism and Relictness in Indo-China」(第11回)を開催しました。ベトナム、ラオス、インドネシア、ミャンマー、ネパール、スリランカ、台湾、中国、イタリア、日本から51名が参加しました。

■ 2023年11月10日 — アフリカ熱帯及びマダガスカルのみからしか知られていなかったEburopone属のアリをベトナム中南部Dak Lak省から発見し、新種Eburopone easoanaとして記載・命名した論文(主著者・責任著者:山田藍生)がZooKeys誌に掲載されました。同様の分断分布の事例は、私たちの研究室に所属していたRijal SatriaさんらによってXymmer属でも発見されています(Satria et al., 2016)。系統的に離れた属で同様の分布パターンが見られることは興味深いです。

■ 2023年10月11日 — 私たちがアシジロヒラフシアリ八丈島個体群の防除用に開発したハイドロジェルベイト剤が、侵略的外来種アルゼンチンアリの防除にも有効であることを示す論文がApplied Entomology and Zoology誌に掲載されました(オンライン)。

■ 2023年9月29日 — 「The 2nd International Conference and The 11th Congress of The Indonesian Entomological Society 2023」に招待され、「Taxonomy and biodiversity conservation, with examples of terrestrial invertebrates found in the Ryukyus」というタイトルで講演(オンライン)を行いました。

■ 2023年8月11日 — 日本産の「短肢系ホラヒメグモ類」に関する論文(Ballarin & Eguchi, 2023, ZooKeys)の紹介が東京都立大学よりプレスリリースされました(。

■ 2023年8月11日 — 日本産の「短肢系ホラヒメグモ類」は3種とされてきたが、DNA塩基配列情報に基づく系統解析および種判別解析と形態学的観察を組み合わせて再検討したところ、Nesticella属6種、Howaia属3種が識別されました。琉球列島からは5新種が発見され、そのうち3新種は完全に洞窟生活に適応した種(真洞穴棲種)でした。以上の内容を含む論文が、ZooKeys誌に掲載されました。

■ 2023年6月28日 — 日本昆虫学会「昆蟲(ニューシリーズ)」編集長として、新しい連載「ABS 時代の生物多様性研究の新たなる地平」を開始しました。生物多様性条約・名古屋議定書に関連する国内外の法的措置に関する情報、具体的な手続きなどを発信していく予定です。合わせて、バランスの取れた枠組みづくりについて提案していきたいと思います。

■ 2023年6月18日 — 日本甲虫学会様からの依頼に基づき、名古屋議定書(ABS)の基本的な考え方や、必要とされる対応方法について、経験を交えて講演しました。

■ 2023年3月10日〜24日 — コロナ禍後の初の海外調査として3年半ぶりにベトナムを訪問し、ベトナム生態学生物資源研究所と共同で、Vu Quang国立公園(Ha Tinh省)、Pu Hoat自然保護区(Nghe An省)で野外調査を行いました。

■ 2023年2月25日 — 日本昆虫学会様からの依頼に基づき、名古屋議定書(ABS)の基本的な考え方や、必要とされる対応方法について、経験を交えて講演しました。

■ 2023年2月24日 — インドネシア・アンダラス大学と共同で、オンラインセミナー「Genetic and Species Diversity, Endemism and Relictness in Indo-China」(第10回)を開催しました。インドネシア、フィリピン、ベトナム、台湾、ラオス、ミャンマー、ネパール、スリランカ、日本から151名が参加しました。

■ 2023年2月15日 — 当研究室の客員研究員である寺山守さんが、環境省が開催する「令和4年度ヒアリ講習会」(名古屋会場:ハイブリット)で講師を務めました。

■ 2023年2月8日 — 軍隊アリ亜科の中で生活史が不明であったYunodorylus属について、ベトナム南部のLo Go Xa Matで江口が採集したY. eguchiiの女王を含むコロニーの長期飼育に基づき、社会構造、繁殖サイクル、餌選好性を明らかにした論文が、Insectes Sociauxにてオンライン先行公開されました。Lo Go Xa Matでの楽しい日々が思い出されます。

■ 2023年2月4日 — 東京都生物教育研究会からの依頼で、生物多様性の理解を目的とし、土壌動物を材料とする実験・観察指導案について、講義(解説)と実習(手技)を提供しました。日本の土壌動物の系統分類学は、先人たちの形態学的な研究の積み重ねにより、非常に高い水準まで発展しています。そして、最近では、より先端的な手法(分子系統解析や三次元イメージングなど)を取り入れて、さらなる高みを目指した研究が精力的に行われています。土壌動物が教材として使われていく中で、土壌動物の系統分類学の次世代を担う人材が次々と育ってくることを望みます。

©2020 Department of Biological Sciences, Tokyo Metropolitan University