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Katsuyuki EGUCHI, Assoc. Prof.

Systematic Zoology Group

■ キーワード  Keywords

Taxonomy, Systematics, Museomics, Terrestrial Invertebrates, Soil Fauna, Field Research, Southeast Asia, Cave, Introduced Species, ABS (Nagoya Protocol), Local Contribution

Taxonomy, Systematics and Phylogeography of Terrestrial Invertebrates

The Indochina region is a region of high species diversity, endemism, and persistence in various flora and fauna groups. In addition, in the mountainous areas of northern Indochina, the faunas of the Palearctic and the Oriental realms are mixed.
Our research group is working on various taxa of terrestrial invertebrates in Southeast Asia, especially in the Indo-China region, aiming to elucidate local faunas, to update the classification (taxonomic system), and to understand the spatial distribution of taxa and their formation process. We use not only morphological observations and analyses but also phylogenetic analyses for sequence datasets obtained by Sanger sequencing as well as next-generation sequencing.
I have collaborated with researchers affiliated with institutions in Vietnam, Laos, Thailand, Malaysia, Indonesia, Brunei, Taiwan, China, and other countries, and have conducted joint research and field surveys. Our research has covered a wide range of invertebrate taxa, including ants, wasps, hemipterans, termites, centipedes, millipedes, symphylans, spiders, pill isopods, and blood-sucking leeches, and the results have been published in numerous papers.

■ プレスリリース Press release

■ EurekAlert!


Our group has accepted many international students from Southeast Asian countries and regions who will become the future leaders in biodiversity research.

■ 留学生受入実績

■ JSPS外国人特別研究員受入実績
2018年11月〜2020年11月:Francesco Ballarin、イタリア

■ Hosting foreign students funded by TM (Tokyo) or MEXT (JAPAN)
2022/10 – 2024/09: MC, Laos, TM
2022/10 – 2024/09: MC, Nepal, TM
2022/10 – 2024/09: MC, Sri Lanka, TM
2022/10 – 2025/09: DC, Laos, TM
2021/10 – 2023/09: MC, Indonesia, TM
2019/10 – 2021/09: MC, Vietnam, TM
2018/10 – 2023/09: MC+DC, Vietnam, TM
2018/10 – 2021/09: DC, Taiwan, TM
2017/10 – 2021/09: RS+DC, Vietnam, MEXT
2016/10 – 2019/09: DC, Vietnam, TM
2014/10 – 2017/09: DC, Indonesia, TM
2014/10 – 2017/09: DC, Vietnam, TM

■ Hosting JSPS Postdoctoral Fellowships for Research in Japan
2022/11 – 2024/11: Taiwan
2018/11 – 2020/11: Italy
Other Activities
■ 海外との学術交流  Academic International collaboration

As a part of the National BioResource Project (Phase 5), supported by the Ministry of Education, Culture, Sports, Science and Technology of Japan (MEXT), our group has launched "Support for the Access and Use of Genetic Resources in Biodiversity Science, based on the Study of ABS-related Cases in Asia," and has provided advice and support to domestic research institutions on how to comply with new rules and customs related to CBD-ABS (the Nagoya Protocol), and collect information on laws and regulations related to ABS outside Japan.

In collaboration with overseas collaborators, our group has organized research meetings and workshops on terrestrial invertebrates and other wild organisms in Southeast Asia. In addition, taking advantage of the financial support provided by the Graduate School of Science of TMU and other programs, graduate students stay for one to two months at joint research institutions in Vietnam and other countries, and conduct field research and workshops with graduate students and young researchers at the sending institutions. Young researchers from overseas frequently visit our laboratory to conduct field research and laboratory experiments with Japanese members.

■ 自治体との連携事業  Collaborative Projects with local governments

In cooperation with the Tokyo Metropolitan Government and local governments in Tokyo, we are working to elucidate the distribution status, habitat suitability, and life history of introduced invertebrates in the Ogasawara Islands and Izu Islands.

■ 学外委員など  Off-campus Professional Activities
ベトナム科学技術アカデミー発行「Academia Journal of Biology」誌・編集委員会委員
「Myrmecological News」誌・編集アドバイザー
Francesco Ballarin特任助教が行っている研究
Research being conducted by Assistant Prof. Francesco Ballarin

My research area of interest is principally focused on the study of the evolutionary and biological processes that shaped the modern distribution of subterranean and soil fauna in Eurasia in relation with climatic and geological events occurred during the Cenozoic Era. In my studies I use spiders (Arachnida, Araneae) as the main model animal of which I study in detail taxonomy, phylogeny and biogeography. I am also interested on the study of the ecology and conservation of the invertebrate fauna in caves and the effect of the Global Warming on their communities.
Since 2010 I am member of the International Society of Arachnology and the International Society of Speleology. In the past years I had the occasion to visit numerous caves and survey the subterranean habitats in several different countries in Eurasia (China, France, Greece, Italy, Japan, Philippines, Spain, Taiwan, Thailand, etc.). Results of these studies have been summarized in several international journals and reported in local and international congresses. One of my works in particular shed new light on evolution of Asian cave spiders highlighting how epigean were forced to adapt to subterranean environment by the rising adverse conditions occurred during the Mid-Miocene Climatic Change (~14 Mya). My current working web involves collaborations with several researchers from international institutes in Europe and Asia. In addition to taxonomy, evolution and diversity of subterranean organisms I am also working in conservation of subterranean environments and the effects of invasive species on endemic cave fauna.
具体的な研究 (1) — ナギナタアリOpamyrma hungvuong Yamane, Bui & Eguchi, 2008の比較形態学的研究
Unveiling the morphology of the Oriental rare monotypic ant genus Opamyrma Yamane, Bui & Eguchi, 2008 (Hymenoptera: Formicidae: Leptanillinae) and its evolutionary implications, with first descriptions of the male, larva, tentorium, and sting apparatus
 極めて発見例の少ないナギナタアリOpamyrma hungvuong Yamane, Bui & Eguchi, 2008のコロニーをベトナム北部と中国南部(広西)から再発見し、オスや幼虫も含めた包括的な形態学的記載を初めて行った。本種は最近の分子系統学的研究でムカシアリ亜科の最も分岐の古い系統である可能性が示唆されていたが、今回、形態学的にもそのことを支持する証拠が得られた。特に重要な知見として、本属を含むムカシアリ亜科のアリは、他のアリとは大きく異なる毒液排出機構を共通して持つことがわかった。本亜科に属するムカシアリ属やジュズフシアリ属では、アリ類で一般的に見られる毒液を送り出すための弁(lancet valve)が失われており、代わりに毒嚢の収縮による力を用いて毒液を排出していると考えられていた。今回、ナギナタアリの毒針形態を調べたところ、本種もこの特徴を共有していることがわかった。このことは、弁の欠失と毒嚢の収縮による毒液排出機構が本亜科の共有派生形質であることを示唆していた。

The monotypic genus Opamyrma Yamane, Bui & Eguchi, 2008 (Hymenoptera, Formicidae, Leptanillinae) is an extremely rare relictual lineage of apparently subterranean ants, so far known only from a few specimens of the worker and queen from Ha Tinh in Vietnam and Hainan in China. The phylogenetic position of the genus had been uncertain until recent molecular phylogenetic studies strongly supported the genus to be the most basal lineage in the cryptic subterranean subfamily Leptanillinae. In the present study, we examine the morphology of the worker, queen, male, and larva of the only species in the genus, Opamyrma hungvuong Yamane, Bui & Eguchi, 2008, based on colonies newly collected from Guangxi in China and Son La in Vietnam, and provide descriptions and illustrations of the male, larva, and some body parts of the worker and queen (including mouthparts, tentorium, and sting apparatus) for the first time. The novel morphological data, particularly from the male, larva, and sting apparatus, support the current phylogenetic position of the genus as the most basal leptanilline lineage. Moreover, we suggest that the loss of lancet valves in the fully functional sting apparatus with accompanying shift of the venom ejecting mechanism may be a non-homoplastic synapomorphy for the Leptanillinae within the Formicidae.

■ 論文  Article
Yamada A, Nguyen DD, Eguchi K. 2020. Unveiling the morphology of the Oriental rare monotypic ant genus Opamyrma Yamane, Bui & Eguchi, 2008 (Hymenoptera: Formicidae: Leptanillinae) and its evolutionary implications, with first descriptions of the male, larva, tentorium, and sting apparatus. Myrmecological News, 30, 27-52.
具体的な研究 (2) — 日本最大の新種のオオムカデの発見 — 形態観察と分子系統解析を組み合わせた種分類
A new amphibious species of the genus Scolopendra Linnaeus, 1758 (Scolopendromorpha, Scolopendridae) from the Ryukyu Archipelago and Taiwan
オオムカデ属Scolopendra Linneus, 1758は、分類学の父リンネによって創設された分類群である。世界からは100種が記載されているが、多くの種では散発的な分布記録があるだけで、分布範囲の詳細は不明であり、再検討を要する状況にある。大型であるため、種間差を示す特徴を多く持ちそうに思うかもしれないが、実際には、種の間での形態的な差異が少ない一方で、色彩などには種内でしばしば大きな個体差が見られることが知られており、種レベルの分類が混沌としている。
日本からはこれまで、「トビズムカデ (Scolopendra mutilans)」、「アオズムカデ (Scolopendra japonica)」、「タイワンオオムカデ (Scolopendra morsitans)」、「オオムカデ (Scolopendra subspinipes)」が記録されていた。しかし、沖縄県本島北部の、やんばる地域にはかなり前から大型のオオムカデがいることが噂となっており、2010年ごろからは飼育愛好家の間では広く知られる存在になってきた。しかし、生息場所であるやんばる地域の自然環境が開発によって破壊されていく中、個体群の減少や絶滅が危惧されたため、種としての実態を明らかにすることに着手した。様々な行政的措置を行う上で、種名が確定していることが極めて重要だからである。
本種が美しい青緑色(ひすい[翡翠]色)の体色をしていることと、川に飛びこむ姿から、同様に美しい体色 の鳥であるカワセミとおなじく、ギリシャ神話の女神アルキオーネの名前にちなみ、学名を Scolopendra alcyona とした。一方、和名は沖縄の故事にちなんでリュウジンオオムカデ(琉神大百足)とした。体長約20cm、体幅2cm以上になる巨大種である。沖縄本島北部(やんばる地方)の深い森、久米島、西表・石垣島、渡嘉敷島、そ して、台湾に生息することが判明している。身の危険を感じると水中に逃げ込み、じっと身を隠す習性をもつ。さらに、同地域に生息し、体調10cmにもなる日本最大の川エビ「コンジンテナガエビ」を捕食しているところが目撃されている。過去に半水棲ムカデは、2016 年にラオス、ベトナム、タイから 1 種、2018 年にフィリピンからの 1 種が報告されて おり、世界で 3 例目となる。
日本からオオムカデ属の新種が記載されるの は、アオズムカデ(Scolopendra japonica)とトビズムカデ (Scolopendra mutilans)がドイツ人の手によ って 1878 年に新種記載されて以降、実に 143 年ぶりとなる。また、日本人の手によって、オオムカデ属の 種が記載されるのは初めてであり、多数の地元の方々の協力なしにはあり得なかった快挙である。21 世紀に入 ってからの、これほどの巨大な陸上無脊椎動物の新種の発見は、沖縄の島々に未知の生物がまだ数多く存在す ることの証左であり、生物多様性や生態系の包括的な保全の必要性を訴えかけるものである。

In Japan and Taiwan, five valid species of the genus Scolopendra Linnaeus, 1758 have been described: S. morsitans Linnaeus, 1758, S. subspinipes Leach, 1816, S. mutilans Koch, 1878, S. japonica Koch, 1878, and S. multidens Newport, 1844. Recently, an undetermined species was found in the Ryukyu Archipelago and Taiwan. Using molecular phylogenetic analyses with mitochondrial COI and 16S rRNA and nuclear 28S rRNA and 18S rRNA genes as well as conventional morphological examination, we successfully discriminated this sixth species as an independent lineage from S. subspinipes, S. mutilans, and other named congeners from East and Southeast Asia. Therefore, the species was described as S. alcyona Tsukamoto & Shimano, sp. nov. Several situational evidences suggest that this species prefers streamside environments and exhibits amphibious behavior.

■ 論文  Article
Tsukamoto S, Hiruta SF, Eguchi K, Liao J-R, Shimano S. 2021. A new amphibious species of the genus Scolopendra Linnaeus, 1758 (Scolopendromorpha, Scolopendridae) from the Ryukyu Archipelago and Taiwan. Zootaxa, 4952, 465-494.

■ プレスリリース  Press release

■ EurekAlert!
具体的な研究 (3) — ベトナムに産するアサヒハエトリグモ属(ハエトリグモ科)の種分類体系の再検討
Revision of the species-level classification of Vietnamese species of the genus Phintella (Family Salticidae)
 ベトナム生態学生物資源研究所の常勤研究員であるPhung Thi Hong Luong氏は、アジア人材育成基金留学生として、江口の研究指導のもとで、アサヒハエトリグモ属の種多様性の解明に取り組んだ。(2017年9月に理学博士号を取得)。

Dr. Phung Thi Hong Luong, a researcher at the Institute of Ecology and Biological Resources in Vietnam, worked under my supervision as a scholarship phD student supported by Asian Human Resources Fund, Tokyo Metropolitan Government and elucidated the species diversity of the jumping spider genus Phintella in Vietnam. She received his Ph.D. in Science in September 2017.
Jumping spiders, or the family Salticidae, are dominant wandering arachnids in tropical and subtropical regions and are a large presence in terrestrial ecosystems as predators of insects and other terrestrial arthropods. The family is taxonomically diverse, with approximately 6,000 valid species (10% of the total number of known spider species), but its taxonomic system is confusing. Because of the very large differences in shape and coloration (sexual dimorphism) between conspecific male and female adults, conspecific male and females have often been classified as different species or even different genera. That is to say that male-based and female-based classifications coexist, and many synonyms are expected to remain. On the other hand, a large number of undescribed species are expected to exist.
In order to solve this problem, she collected a large number of Phintella specimens from Vietnam, and obtained morphological information from each specimen, such as coloration in fresh conditions, DNA sequences of multiple gene regions, and morphology of male and female copulatory organs, which she used in an integrated manner to accurately discriminate the species and to elucidate the correspondence between males and females. As a result, 22 species were discriminated and identified, including 12 new species, increasing the number of known species in Vietnam by 2.5 times.
We Welcome Undergraduate and Graduate Students, and Post-docs!

We are looking for students, graduate students, and post-doctoral fellows who want to engage in interdisciplinary research related to systematics, biogeography, biodiversity informatics, or any combination of these fields! We are conducting international research projects in collaboration with overseas institutions in Vietnam, Indonesia, Thailand, Malaysia, Taiwan, and other countries. If you are a graduate student or above, you can conduct field research in these countries and regions. We also provide consultation for working people (employed people) who wish to enter graduate school. We are always available for consultations by e-mail or in person via Zoom. Visits to our laboratory are also welcome (please send us an email to me in advance).

■ JSPS特別研究員受入実績

■ Hosting JSPS Research Fellowship
2020/04 – 2022/03: DC2
2014/04 – 2017/03: PD
Current Activities (within a year)
Sorry, Japanese only!

琉球列島からマシラグモ科の2新種、Longileptoneta yamasakii と Masirana suzukii、を記載・命名した論文が、Zootaxa誌に掲載されました。Longileptoneta属(ナガマシラグモ属:和名新称)は日本から属レベルでの初記録となります。コロナ禍で海外渡航が難しくなる中で、新たに開始した琉球列島の林床棲節足動物の種相の分類学的、系統地理学的解明を目指したプロジェクトの成果が少しずつ出始めました。(2022年11月28日)

JSPS外国人特別研究員が台湾より無事入国できました。当研究室で日本産ハダニ類をモデルとして陸上の微小な節足動物のIntegrative Taxonomyの実践と、簡易同定システムの構築に取り組みます。(2022年11月25日)





当研究室出身のRijal Satriaさん(パダン州立大学)がスマトラからカドフシアリ属の1新種を記載した論文が、Far Eastern Entomologist誌に掲載されました。(2022年10月4日)

当研究室、森林総合研究所、八丈町の共同で行ってきたアシジロヒラフシアリ防除に関する論文が、Pest Management Science 78巻10号の表紙を飾りました。(2022年9月4日)


ベトナム中部から発見されたサシガメ 類3新種を記載、命名した論文が「ZooKeys」誌に掲載されました。(2022年8月24日)

日本最小クラスのジムカデ類の2新種を記載、命名した論文(Tsukamoto et al., 2022, ZooKeys, 1115, 117-150)が、東京都立大学、法政大学より同時プレスリリースされました。(2022年8月22日)

国立遺伝学研究所 ABS学術対策チームが主催する2022年度第2回ABS講習会に江口が講師として招聘され、「アジア諸国の遺伝資源の取得手続き」というタイトルで、東南アジア地域に産する野生生物を用いた研究を行う際のABS対応についてオンライン講義を行いました。200名を超える参加がありました。(2022年8月9日)

日本最小クラスのジムカデ類の2新種を記載、命名した論文が「ZooKeys」誌に掲載されました。そのうち全国的に分布する新種Nannarrup innuptusの性別判定が可能な成体・亜成体71個体は全てメスであったことから、単為生殖種と考えられます。単為生殖はムカデ類では稀であり、ナガズジムカデ科では2例目です。一方、新種N. oyamensisでは雄標本が得られているため、両性生殖です。(2022年8月1日)

高知県日高村猿田洞からイシカワマシラグモ Masirana glabra を65年ぶりに再発見し、再記載とCOI塩基配列の登録を行いました。メス成体は本研究で初めて確認、記載されました。以上はActa Arachnologica誌に掲載されました。本研究にご協力くださった日高村教育委員会の皆様、ありがとうございました。(2022年6月30日)

八丈島で家屋害虫となっている難防除侵略的外来種アシジロヒラフシアリの2020年秋の分布状況を報告した短報が、昆蟲(ニューシリーズ)に掲載されました。2016年(Ogura et al. 2017)よりも分布域の拡大、高密度化が示されましたが、森林内への本格的な侵入・定着はまだ起こっていないことがわかりました。(2022年6月25日)


ベトナムの洞窟から発見されたタマヤスデ 類2新種を記載した論文が「ZooKeys」誌に掲載されました。(2022年6月24日)


八丈島で家屋害虫となっている難防除侵略的外来種アシジロヒラフシアリに対して有効な誘引成分、殺虫成分を検討し、ハイドロジェルベイトを作成し、またそれを用いた住民参加型の防除プログラムを考案、実施しました。その結果、本種の個体密度を1ヶ月程度劇的に減らす効果が見られました。そのことを報告した論文が、Pest Management Science誌に掲載されました。(2022年6月1日)




ベトナム北部の産地から発見されたヤスデ類の1新種Tylopus helicorthomorphoidesの記載論文が、「ZooKeys」誌にて公開されました。(2022年3月31日)

インドネシアのPadang州立大学、ベトナム生態学生物資源研究所と共同で、オンラインセミナー「Genetic and Species Diversity, Endemism and Relictness in Indo-China」(第7回)を開催しました。インドネシア、ラオス、ミャンマー、タイ、スリランカ、ベトナム、イタリア、日本から128名が参加しました。(2022年3月29日)


Mahasarakham大学(タイ)、National University of Laosと共同で、オンラインセミナー「Genetic and Species Diversity, Endemism and Relictness in Indo-China」(第6回)を開催しました。タイ、ラオス、ベトナム、ミャンマー、スリランカ、インドネシア、イタリア、日本から41名が参加しました。(2021年12月21日)

©2020 Department of Biological Sciences, Tokyo Metropolitan University